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骷髅1号的变异池并不在埃及金子塔内，它在很远的中美洲，当然是当时太古大陆分裂，真是地动山摇的，骷髅1号选了美洲的黄金湖做为基地。
变异的生物多数没有什么脑活动，只是一味听从命令进行杀戮。但是，同样是变异的战士，骷髅们不同，上乘的骷髅们还是有脑活动，他们只是变异了身体，更加强壮，更加魁梧，面容也变得狰狞，他们还是有清醒的意识，而且，极力杀掉所有的亚特人，这样美丽又高傲的亚特人，是他们认为与神争光辉的人，是这个世界害虫的代名词，所以，一定要杀掉。
骷髅们的首领已经自杀死掉了，但骷髅还是畏惧自然和神，用他们的话来讲：他们是神的代言人，神说杀掉亚特人，他们就毫不怀疑神谕，坚定执行神的命令，以求换来自保，而不被神消灭。
黄金湖的地点很隐秘，而且那里的生态看不出一点异常，所以，世界各地都有变异生物，但是，那里却很和平，而且那里还有几个亚特人，那些人丝毫不知道，变异池就在那里。那里变异池扔下的亚特人都是从很远的地方抓过去，变异的生物又偷偷运出去。所以，正和和南没有找到黄金湖这里来。而且，这个湖后来的玛雅人称为圣湖，也是因为这里的生态好。
骷髅们日夜都在清理着抓到的亚特人，而进入基地的其他亚特人，他们就让其消失。他们够不到已经去了外太空的亚特人，对待抓到的人极其残忍。不过，的确有骷髅混入去外太空的亚特人中，骷髅们的目标一致，杀死神的对头，自诩为神的亚特人。
骷髅们想得到南的灵虫，那个几万年来的预言虫，可是，这一切是有阻碍的，那就是美杜莎和其他活着的亚特人。他们妨碍着骷髅们。