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远在西沙群岛的三人听闻了钓鱼岛上的惨案后，一时难以置信，他们捶胸顿足，懊悔不已。在得知孩子们还活着以后，商议陈精锐暂时留下，应对随时可能出现的怪兽Maryway，其他两人则直接变身成米利尼安与达克，以极高的速度飞回腾格里沙漠。
李千禧：（看到维生装置内半人半蜥蜴的羲和心痛不已，扑在透明壁板上）小羲！你醒醒啊！你怎么了！
诺兰：（保持理智，询问卢俊义）首长，这到底是是怎么回事，发生了什么？她们怎么会变成这个样子？
卢俊义：（心虚，强装镇定，毕竟面对的是拥有超人力量的奥特曼）你们两个跟我来。
两人被带到会议室，徐世勣在电脑上打开从总部废墟中挖掘出的绝密磁盘，内容如下：
1994年7月17日4时15分到22日8时12分，“苏梅克-列维9号”彗星与太阳系中最大的行星木星相撞，破坏力相当于20亿颗核弹爆炸。
正因为木星巨大的体积与吸引力，地球才没有成为被撞击的目标，否则地球上的生命将不复存在。
1994年12月1日凌晨3时20分左右，一艘自木星撞击事件后停泊在太阳系的外星飞碟暂时来到地球避难，飞行到贵阳市北郊18公里处的都溪林场时受到雷暴天气影响，将冰雹与雨泥抽进了飞行系统，影响了飞碟的升力，导致直径达200米的外星飞碟开始跳跃式降落，造成林场五片区域的马尾松林几乎全部被摧毁，飞碟强大的磁场使得周边地区电力被屏蔽，以及火车、仓库、金属器材均受到位移、损毁。
飞碟中的外星人遭受伤亡，只得向中国政府发出无线电波求救，随后政府部门将这一带封锁，接纳了这批宇宙难民，十三个外星幸存者以提供尖端科技为回报与中国政府合作。
2007年4月19日，一颗巨型陨石坠落日本海，导致地轴偏斜，引发巨大海啸，淹没日本岛及中国大陆部分沿海城市，地球气象剧变，超过三分之一的陆地在十五年间沙漠化。
以中国为首的幸存国家接受了外星人的指引成立地球防卫军BASE，对抗未来将袭击人类聚居地的星际怪兽。
2013年地球防卫军答应外星人的要求，挑选出十三名人类中最优秀的女性，结合外星人的基因培育出了十三名人造人类（实际只有十二名），但当时具体是出于什么目的，人类不得而知，此秘密项目代号为“女娲计划”。
2023年地球防卫军以战力协助为由要求李千禧加入BASE甘肃分部，暗中取得李千禧的基因样本与变身装置，开始着手研发人造兵器，即人造奥特曼，此秘密项目代号为“超人计划”，短期内便制造出了三十个人造奥特曼。
诺兰：这十三个外星人就是“预言者”吗？
徐世勣：是的，我们想问的是在BASE总部究竟发生了什么？
诺兰：你们得先告诉我钓鱼岛上发生了什么。